Kamizaka Haruhi quando era pequena, foi salva por um mago e decidiu tornar-se uma maga. Então ela matriculou-se em uma escola especial onde havia aulas normais e de magia em dois cursos independentes. Junto com sua melhor amiga e rival Hiiragi Anri, elas estudam magia enquanto procuram pelo menino que a salvou anos atrás para entregar-lhe o chocolate do Dia dos Namorados.