Uma pequena porcentagem de adolescentes tem início de habilidades especiais. Yu Otosaka habilmente usa uma habilidade que domina o corpo de um alvo por cinco segundos para viver a vida escolar de um estudante de honra e é aceito em uma prestigiada escola secundária. Quando Yu está prestes a viver uma vida estável no ensino médio, uma garota chamada Nao Tomori aparece diante dele …